biodata

Сидели с Иваном Моргуновым и обсуждали кейс Дейва Паско (Dave Pascoe) (https://vk.com/video-229018404_456239048) американского биохакера 62 лет.

Мы не покупаем фотки обмазанного маслом Дейва из бани, поэтому разбирались основательно, и не во всем мы поддержали Дейва, но любом случае он попадает в наш watch-list и будем отслеживать его успехи.

У нас остались вопросы, и в любом случае, чего за глаза кости промывать) Отправил приглашение, зададим ему наши вопросы, если придет к нам на стрим.

Тут важное событие (https://www.microsoft.com/en-us/research/blog/exploring-the-structural-changes-driving-protein-function-with-bioemu-1/): Microsoft присоединилась к гонке по вычислению протеинов, опубликовав в открытом доступе свою модель Biomolecular Emulator-1 (BioEmu-1). И сразу залидировала в гонке, если правильно понимаю, решив важнейшую задачу моделирования динамического поведения белков.

Как раньше отмечалось, уже известная нам модель AlphaFold версий 1-2-3 решает задачу воссоздания наиболее вероятной статической структуры белка по его аминокислотной последовательности. Однако в ходе модификаций в течение своего жизненного цикла белок неоднократно меняет форму и следовательно, функцию. Этот аспект посттрансляционных модификаций упущен в моделировании AlphaFold, а точнее, правильно сказать, не входит в ее задачи. И вот именно поиск этого многообразия форм решен BioEmu-1. Как описано в публикации, для решения этой задачи BioEmu-1 обучили на трех наборах данных, каждый из которых придал конечной модели отдельные важные свойства, а уже их синергия обеспечила решение:

(1) База данных AlphaFold (AFDB) (https://alphafold.com/) (обеспечивает выделение диапазона возможных структур);

(2) набора данных моделирования молекулярной динамики (это данные о динамических модификациях белков, полученные как прямым наблюдением в микроскопах, так и описания физико-математическими моделями); этот датасет позволил предсказывать физически правдоподобные структурные изменения, отображая множество возможных структур, которые может принять один белок;

(3) экспериментального набора данных стабильности сворачивания белка (https://www.nature.com/articles/s41586-023-06328-6) (позволяет выбирать свернутые и развернутые структуры с правильными вероятностями).

Оказывается, принципиальный препринт (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.05.626885v1) этого результата вышел еще в декабре, но я его проглядел. Да и эту ссылку мне прислал подписчик. Спасибо ему)

Надо продолжать читать обзоры по этой публикации и вникать дальше, но еще раз, если правильно понимаю, то решена именно та проблема, за которую скептики ругали AlphaFold.

Заметили косяк в моем изложении? Отпишитесь в комментах, давайте обсудим)

Время моего доклада переехало на 12:30, 16 февраля (в воскресение) и (вроде) окончательно установилось. Это Малый зал. Поговорим о том, почему мы думаем, что имеем шансы победить старение. Вопрос непраздный, все-таки 100+ миллиардов человек умерло за всю историю человечества (https://www.weforum.org/stories/2022/04/quantifying-human-existence/), и у них почему-то не получилось, хотя они тоже хотели.

Если вы рассчитывали на утро, не беспокойтесь, со всеми, с кем хотели увидеться, все равно сможем увидеться, я оба полных дня буду на конференции, а слайды будут потом тут)

на связи (https://t.me/+oHwlVMn2WS81ZTQy)

Связь людей - истинная сила. А связи формируются в том числе на мероприятиях, и поэтому ловите список крупных мероприятий в отрасли Longevity 2025 года (https://docs.google.com/spreadsheets/d/12No0fw_f2ca7AmSxLOteFf_yJ-vU2lfoyk-5zcq8hkA/edit?gid=0 =0) по всему миру, который мы курируем для нашего сообщества предпринимателей. Если вы захотите добавить известные вам мероприятия, оставьте комментарий к посту, или напишите мне в тг на .

Что за сообщество: летом 2024 года совместно с еще 4 предпринимателями я основал сообщество предпринимателей за радикальное продление жизни. Рабочее название LessDead, мы находимся в полу-stealth режиме и набираем участников.

Что делаем полезного: объединяем предпринимателей в направлении Longevity, потому что победа в конечном итоге придет не от государства, не от ученых, и не от инопланетян, а от прорывных инженерных проектов, подобных 23me, Altos Labs, компаний из портфеля Apollo Health или OS Fund, и подобных им стартапов.

Денег не даем) но можем помочь сориентироваться в ландшафте технологий и найти нужные контакты.

Участие в сообществе бесплатное, но есть правила)

1) Вы должны быть предпринимателем в области longevity или искать вход в эту отрасль.

2) Вы должны поддерживать идею радикального продления жизни (цель — превышение текущего максимума в 120 лет).

3) Псевдонаука и ложные заявления не допускаются. Сложные случаи должны быть подтверждены публикациями или разбираются экспертным советом.

4) Принимаются только продукт-ориентированные предприниматели (например, допускаются IT, wet-biotech, deep tech и т.д., а инфобизнес и консалтинговые модели не принимаются).

5) Недобросовестная конкуренция (разглашение конфиденциальной информации, инсайдерская торговля, взятки и т.д.) запрещена.

По всем вопросам: в тг на

на связи (https://t.me/+oHwlVMn2WS81ZTQy)